В целях развития современной молодежи в Университете ИТМО проводится ежегодный Конгресс молодых ученых (КМУ). Участники на КМУ погружаются в современную научную среду, представляя результаты своих исследований, обмениваясь опытом с единомышленниками в самых передовых технологических областях. Сегодня КМУ — это научные школы, круглые столы и конкурсы докладов. Авторы лучших докладов имеют возможность публиковаться в сборнике трудов, индексируемом РИНЦ.
По результатам конкурсов КМУ школьники получают дополнительные баллы к ЕГЭ при поступлении в Университет ИТМО. А победа в конкурсе докладов для поступающих в магистратуру засчитывается в качестве вступительного испытания при поступлении в университет. Статус Конгресса — всероссийский